Генеральным директором Российского научного фонда стал Александр Хлунов, до этого занимавший должность начальника управления президента по научно-образовательной политике. Указ о назначении гендиректора фонда выложен на официальном портале правовой информации.
Хлунов курировал создание фонда со стороны Кремля. Осенью он неофициально упоминался в числе кандидатов на пост пост руководителя Федерального агентства научных организацией. В итоге ФАНО возглавил бывший замминистра финансов Михаил Котюков. Хлунов до управления президента по научно-образовательной политике работал в департаменте науки, высоких технологий и образования правительства РФ, Министерстве образования и науки, Российском институте стратегических исследований и посольстве России в США.
12 декабря был утвержден состав попечительского совета Российского научного фонда. Его возглавил бывший министр образования и науки, помощник президента Андрей Фурсенко. В совет вошли бывший министр финансов Алексей Кудрин, министр образования и науки Дмитрий Ливанов, депутаты Госдумы Михаил Дегтярев и Иван Мельников, директор Института всеобщей истории РАН Александр Чубарьян и другие.
Российский научный фонд был создан летом 2013 года. Ученые высказывали недоумение по поводу того, как его деятельность будет соотноситься с уже существующими Российским гуманитарным научным фондом и Российским фондом фундаментальных исследований. Ливанов, разъясняя необходимость создания нового фонда, говорил, что новый фонд создаст «лучшие, чем есть сейчас, условия финансирования». Какими именно будут эти условия, до сих пор неизвестно.